获奖年度 获奖名称 主要完成人 获奖类别 获奖等级 完成单位
2013/10/28 杨春皓 明治生命科学奖 科学奖 中国科学院上海药物研究所
2013/02/01 果德安 Norman Farnworth卓越研究奖 卓越研究奖 中国科学院上海药物研究所
2012年12月 一类新药“雷腾舒”（LLDT-8）的重要中间体雷酚内酯甲醚的合成 李援朝、周兵、杨亚玺、冯慧瑾、陈红莉 上海药学科技奖 二等奖 中国科学院上海药物研究所
2012年12月 青蒿素衍生物免疫抑制活性研究及应用 左建平、李英、唐炜、王峻霞、侯立飞、何世君 上海药学科技奖 一等奖 中国科学院上海药物研究所
2012年 基于G蛋白偶联受体和干细胞的老药新用 谢欣 药明康德生命化学研究奖 学者奖 中国科学院上海药物研究所
2012年 药物分子的高效合成及基于成药性的结构优化 张翱 药明康德生命化学研究奖 学者奖 中国科学院上海药物研究所
2012/12/19 中药复杂体系活性成分系统分析方法及其在质量标准中的应用研究 果德安（北京大学、中国科学院上海药物研究所）、叶敏（北京大学）、吴婉莹、关树宏、刘璇 国家自然科学奖 二等奖 北京大学、中国科学院上海药物研究所
2012/08/31 中国南海软体动物及其食源生物的化学、化学生态学和生物活性研究 郭跃伟、张文、沈旭、李佳、毛水春、李燕、王建荣 中国药学会科学技术奖 三等奖 中国科学院上海药物研究所
2012/07/23 丹参多酚酸盐及其粉针剂 宣利江、王逸平、徐亚明、丁愉、王唯、顾云龙 浦东新区科学技术奖 创新成就奖一等奖 中国科学院上海药物研究所、上海绿谷制药有限公司
2012/06/06 熊兵 中国药学会-施维雅青年药物化学奖 中国科学院上海药物研究所