1932年夏，国立北平研究院院长李石曾（原名李煜瀛）、副院长李书华及中法大学校长李麟玉三人，“鉴于吾国药物科学化之重要，筹办一药物研究所于北平” ，聘时任北平协和医学院药物化学教授兼药理系代主任赵承嘏主持创办药物研究所，经费由国立北平研究院和中法大学共同提供。经短期筹备，“国立北平研究院药物研究所”于1932年9月1日正式开始工作，初设在北平东皇城根42号国立北平研究院理化部内（现北京东黄城根北街16号）。 

研究所以“以最新之科学方法将药物之有效质素发挥而利用之”为初创目的，建立初期，研究范围分三部：化学研究部、药理部和制造部。当时，制造部“出品有麻黄精、止血素、大枫子油素、维他命乙等，颇为医药界所乐用。