上海药物研究所陆晓杰课题组招聘博士后

  中国科学院上海药物研究所陆晓杰课题组通过核酸编码化合物库筛选平台,结合其他药物发现技术的交叉应用来快速发现高价值靶点的小分子先导化合物,加快临床前候选药物的开发。

  研究内容主要包括:

    1) 针对特定靶点的核酸编码集中库的设计,合成和筛选

    2) 和核酸相容能用于核酸编码化合物库合成的化学反应开发

    3) 新型E3连接酶小分子配体的发现和其在新型蛋白降解Protac分子中的应用

    4) 新一代核酸编码化合物库筛选平台的开发

  本课题组的主要研究方向是目前药物筛选非常热门的核酸编码化合物库筛选技术,这一方向在国内的研究非常少,而在制药工业界的需求很大。关于核酸编码化合物库技术在药物筛选的应用请查看Nature和Science最近的报导,以及中文的DEL介绍。这一技术平台已经被制药公司所接受,广泛运用于新药开发。因工作需要拟招聘计算化学博士后1名:

  工作职责:

  1.  结构化信息数据库的搭建

  2.DEL筛选后数据分析,挖掘及整合工作,根据化合物的结构进行分析,推荐化合物

  3.化合物虚拟库的构建,虚拟筛选

  4. 研究化学信息学相关软件,并根据项目要求,通过编程处理特定的化学问题,如化学结构的搜索、修饰,批量编辑等

  5. 利用数据构建机器学习模型

  6. 为各项目技术团队提供其它化学信息学技术支持

  任职资格:

  1. 化学信息学,计算化学,计算机辅助药物设计,或密切相关领域的博士学位

  2. 具备良好的有机合成化学或药物化学知识者优先

  3. 熟悉Linux系统,至少掌握一种编程语言,例如Python,R等,能理解、编辑和应用相关领域的开源代码

  4. 能够运用软件进行数据可视化,分子结构类聚,化学空间分析

  5. 熟悉分子模拟相关软件如Schroedinger,MOE等

  6. 了解常见的机器学习算法及常见软件如PyTorch,TensorFlow 等

  7. 有DEL工作经验者或者高通量DNA测序数据分析经验者优先

  8. 良好的英文阅读能力,能够阅读和理解相关英文文档

  9. 具有良好的团队和奉献精神,工作认真负责

  10.熟悉一种数据库的使用,熟悉SQL语句

  11.熟悉rdkit/cdk/chemaxon等开发软件包


  本课题组从事交叉学科的研究,组员的跨学科组成非常有利于培养复合型的药物研发人员,期待您的加盟。工资以及其他福利待遇将根据申请者的资历及单位相关规定从优办理,。

  有意应聘者请将个人简历和相关教育工作背景材料发至:jfyue@simm.ac.cn 抄送zhaopin@ simm.ac.cn