十年的“文化大革命”使得科研工作受到极大干扰，即使在这样的情况下，全所科研人员仍然坚持“为社会主义出好药、出新药 ”的科研主题。十年中，大家用各种巧妙的方法，坚持八个方面的药物研究和推广应用，即抗肿瘤药物、防治血吸虫药物、国防药物、避孕药、抗革兰氏阴性菌抗菌素、农用抗菌素、神经系统药物以及循环系统药物等，参与了男用避孕药研制的全国会战，并取得了以下主要科研成果：

　　1、在植物药方面研究成功抗肿瘤药长春新碱、喜树碱、羟基喜树碱、三尖杉酯碱、高三尖杉酯碱、治疗慢性气管炎药蔊菜素、引产药芫花萜以及治疗肝炎药垂盆草甙。

　　2、化学合成了抗肿瘤药消瘤芥、溶癌呤、治疗心律不齐药常咯啉以及探亲避孕药双炔失碳酯。

　　3、抗生素方面有抗肿瘤药自力霉素，农用抗生素放线酮，治疗真菌性眼角膜溃疡新药金褐霉素等。

　　4、1995年，6003任务组获国防科研二等奖。